تطبق الأكاديمية في المرحلة الابتدائية برنامج البكالوريا الدولية للمرحلة الابتدائية PYP ويغطي هذا البرنامج الأعمار من ثلاث سنوات وحتى الصفّ الخامس. ويركّز هذا البرنامج على تأهيل وتنمية الأطفال تنمية شاملة داخل المدرسة وخارجها، كما يرتكز هذا البرنامج بقوّة على التعليم الذي يعتمد على الأسئلة والبحث. تعمل الأكاديمية في تطبيقها لهذا البرنامج على تنمية الطفل من جميع الجوانب، الأكاديمية والاجتماعية والعاطفية، مع التركيز على العقلية الدولية المنفتّحة والقيم الأخلاقية الراسخة. كما يعزز البرنامج مهارات التعلم المستقلة، ويشجع كل طالب على تحمل مسؤولية تعلمه. يوجد في المرحلة الابتدائية مساران للصفوف من الأول حتى الخامس، مسار يتم تعليم المواد الأساسية فيه بشكل تكاملي باللغة العربية ويتعلم فيه الطلبة اللغة الإنكليزية بمستوى متقدم، كما يتم تعليم اللغة الفرنسية كلغة ثالثة، ومسار يتم فيه تعليم المواد الأساسية بشكل تكاملي باللغة الإنكليزية ويتعلم الطلبة اللغتين العربية والفرنسية بمستويات مختلفة.  الأكاديمية العربية الدولية حاصلة على الاعتماد لتطبيق كل من برنامج الدبلوم للصفين الحادي عشر والثاني عشر وبرنامج المرحلة المتوسطة للصفوف من السادس إلى العاشر وبرنامج المرحلة الابتدائية التي تشمل الصفوف من الروضة الأولى (عمر 3 سنوات) وحتى الصف الخامس وأصبحت عضواً في عائلة مدارس البكالوريا في العالم.